年画存放的保护方法基本和其他书画类的藏品相同，主要从防虫蛀、强光照射、尘土空气污染以及控制适中的温度和湿度等几方面注意保护。
1.防虫蛀。传统的方法是用冰片、樟脑等物驱虫杀虫。现在大型收藏机构一般采用大型熏蒸房熏蒸杀虫。其方法是，使用环氧乙烷和二氧化碳混合气体(3份环氧乙烷:7份二氧化碳)48小时饱和熏蒸。如果是小批量，则用厚度为12C的PE膜袋，内置樟脑和硅胶、脱氧剂，抽成真空，密封10至20天。每立方米硅胶、樟脑、脱氧剂的用量分别为100克、10克、50克，按此配量可取得较好的杀虫效果。
2.防强光。光线是致使纸张变质的重要因素，藏品储藏室的照明需严格控制好光源照明强度，尤其要避免阳光直射，因为阳光含多种波长不同的辐射能，阳光直接照射在纸上，纤维发生氧化反应，对字画破坏力极大。
3.防尘垢。环境污染对书画的损害非常大，尤其在城市里，汽车尾气和工业污染使空气中的酸碱含量较高，有害气体和细小尘埃悬浮于空中，日久天长沉积在画面上，会侵蚀画面。一般说，一月除尘一次为佳，根据季节变化可适当延长或缩短周期。可用电吹风的自然风挡，将出风口与画面成30度角，保持10～15厘米的距离，从右向左清扫；或将吸尘器开到低风挡，配以软毛刷清扫，在清扫过程中用吸尘器将尘埃吸走(使用此法要特别注意吸嘴与画面的距离以及吸力的大小，以免误伤作品)，也可用鸡毛掸轻轻清扫画面。切不可用抹布一类物品擦拭画面，因为在擦拭的过程中，细小灰尘会进入纸张纹理，造成更大的损害。
4.防高温潮湿。书画最适宜的保存温度为14～18℃，最合适的相对湿度为50%～60%，这样的条件不利于微生物、霉菌的生长和繁殖，因此要保存于通风干湿度适中的场所。控制湿度主要用干燥剂变色硅胶或无水氯化钙，控制温度则可用空调调节室内温度。